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supplement

Amberによる生体高分子シミュレーション入門

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Amber研究会 著
A5判207ページ 定価2,100円(本体価格2,000円)
ISBN978-4-86281-008-3 C3043
世界で最も標準的で広く使われている生体分子シミュレーションソフトウエア「全原子」分子動力学法の「Amber」。実践的シミュレーション技法に焦点を合わせて解説されている。(神戸大学 田中成典 教授による「はじめに」より)
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2D-RMSマップ自動作成ツールの作り方P.112
AmberToolsのptraj“cluster”コマンドを利用したトラジェクトリファイルのクラスタリング 
MOEを利用したドッキングシミュレーションによる酵素―基質複合体の作成方法 
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